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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  31 lines
  1. **********************************************
  2. * Speract receptor repeated domain signature *
  3. **********************************************
  4.  
  5. The receptor  for  the  sea  urchin  egg  peptide  speract  is a transmembrane
  6. glycoprotein of 500 amino acid residues [1].  Structurally  it  consists  of a
  7. large extracellular domain of 450 residues, followed by a transmembrane region
  8. and  a small  cytoplasmic  domain of 12 amino acids.  The extracellular domain
  9. contains four repeats of a 115 amino acids domain. There are 17 positions that
  10. are perfectly conserved in the four repeats, among them are six cysteines, six
  11. glycines, and three glutamates.
  12.  
  13. Such a domain is also  found, once, in  the  C-terminal  section  of mammalian
  14. macrophage scavenger receptor type I [2], a  membrane glycoproteins implicated
  15. in  the pathologic  deposition  of  cholesterol  in  arterial   walls   during
  16. atherogenesis.
  17.  
  18. The signature pattern that we derived spans  part of the N-terminal section of
  19. the domain and contains 8 of the 17 conserved residues.
  20.  
  21. -Consensus pattern: G-x(5)-G-x(2)-E-x(6)-W-G-x(2)-C-x(3)-[FYW]-x(8)-C-x(3)-G
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24. -Last update: May 1991 / Text revised.
  25.  
  26. [ 1] Dangott J.J., Jordan J.E., Bellet R.A., Garbers D.L.
  27.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86:2128-2132(1989).
  28. [ 2] Freeman M., Ashkenas J., Rees D.J., Kingsley D.M., Copeland N.G.,
  29.      Jenkins N.A., Krieger M.
  30.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87:8810-8814(1990).
  31.